El 12 de abril de 1898 se publicó una Real Orden que hacía obligatoria la colegiación médica. Un año más tarde, el 20 de abril de 1899, con el objetivo de acabar con el intrusismo en la profesión y responder a las demandas de la medicina y la salud, se constituyó el Colegio Oficial de Médicos de Gipuzkoa. A partir de finales del XIX, en la historia de la medicina de Gipuzkoa se diferencian claramente dos etapas, una anterior a la Guerra Civil y otra desde la contienda hasta el momento actual.